F3 RC Limited đánh dấu chiến thắng của MV tại giải đua World Supersport Championship 2016.

Phiên bản F3 RC Limited ngoài động cơ 2 xi-lanh thẳng hàng còn nâng cấp toàn bộ công nghệ điều khiển. Chiếc MV F3 RC 675 có công suất 128 mã lực tại vòng tua máy 14.400 vòng/phút, mô-men xoắn cực đại 71 Nm tại vòng tua máy 10.900 vòng/phút.

Phiên bản MV F3 800 có công suất 148 mã lực tại vòng tua máy 13.000 vòng/phút, mô-men xoắn cực đại 88 Nm tại vòng tua máy 10.600 vòng/phút.

Hệ thống điều khiển điện tử MVICS trang bị tiêu chuẩn trên F3, cùng với điều khiển bướm ga điện tử, 8 chế độ kiểm soát độ bám đường. Khung sườn pha trộn giữa khung thép dạng lưới mắt cáo ở phía trước kết hợp với càng làm từ nhôm hợp kim dạng đơn ở phía sau. Hệ thống giảm xóc nâng cấp để phù hợp hơn khi xe chạy với tốc độ cao. 

F3 RC phiên bản giới hạn chỉ có một màu mô phỏng theo chiếc MV Agusta giành chiến thắng trong những giải đua chính.